PT Kanisius, berdiri sejak 26 Januari 1922 sebagai bagian dari inisiatif untuk menerbitkan dan mencetak buku-buku pendidikan dan keagamaan bagi murid-murid di sekolah pribumi di wilayah Yogyakarta dan sekitarnya. Pada perkembangannya, Kanisius kemudian berkembang dan dikukuhkan menjadi sebuah PT pada tanggal 1 Januari 2014.